Au sein de l’équipe Monitoring & Caractérisation Biologique (MCB) de la Direction des Expertises Scientifiques et Technologiques (DEST), vous conduirez une étude de faisabilité visant à optimiser la préparation et l’analyse d’échantillons contenant de faibles quantités d’ADN en vue de leur séquençage long-read.
Vous évaluerez les étapes clés du processus, de la préparation des échantillons à l’analyse des données, afin d’améliorer la qualité et la fiabilité des résultats obtenus.
Missions principales :
- Réaliser une revue bibliographique des méthodes de préparation et d’analyse d’échantillons à faible quantité d’ADN, ainsi que des applications du séquençage long-read en microbiologie environnementale et/ou industrielle,
- Elaborer et optimiser un protocole expérimental couvrant les principales étapes de la préparation de librairie et du séquençage et évaluer différents stratégies permettant d’améliorer la qualité de la données obtenues,
- Comparer les performances du séquençage long-read avec celles de méthodes ou d’approches de référence pertinentes (séquençage short read, qPCR ou la dPCR,...),
- Analyser, interpréter et synthétiser les résultats expérimentaux, pour évaluer la robustesse, la reproductibilité, la sensibilité et la spécificité de la méthode,
- Rédiger des rapports scientifiques écrits et présenter des exposés oraux à l'équipe DEST et aux parties prenantes des unités commerciales,
- Formuler des recommandations claires pour un éventuel déploiement de la méthode ou pour un développement R&D ultérieur.
Nous vous proposons un stage de 6 mois à compter de la mi février 2027.
Vous êtes à la recherche de votre stage de fin d'études d'écoles d'ingénieurs.
- Vous avez des connaissances théoriques et pratiques en biologie moléculaire et des techniques d’analyses associées (séquençage, PCR, …), des connaissances solides en Séquençage.
- Expérience en analyse et traitement des données biologiques, biostatistique.
- Maîtrise des outils informatiques (Google suite ; Python ou R sont un plus).
- Veille/recherche bibliographique
- Français C1 bilingue ou langue maternelle
- Anglais B1 / B2 - Opérationnel
- Capacités à travailler en équipe
- Rigueur et sens de l’organisation
- Esprit d’analyse et capacité à interpréter des résultats expérimentaux
- Aptitude à suivre, optimiser et documenter des protocole.
- Autonomie et goût pour la résolution de problèmes
- Bonnes capacités rédactionnelles et relationnelles
Nous offrons une indemnité de stage et ou une rémunération égale ou supérieure au minimum légaux. Candidat libre du choix de son école.
En tant qu'entreprise inclusive, Veolia s’engage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures, sans discrimination.